Protein–RNA interactions for Protein: P01647

Ig kappa chain V-V region HP 124E1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01647 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01647 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01647 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01647 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01647 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01647 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01647 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01647 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01647 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01647 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01647 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01647 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01647 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01647 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01647 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01647 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01647 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01647 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01647 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01647 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01647 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01647 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01647 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01647 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01647 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01647 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01647 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01647 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01647 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01647 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01647 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01647 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01647 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01647 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01647 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01647 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01647 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01647 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01647 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01647 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01647 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01647 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01647 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01647 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01647 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01647 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01647 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01647 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01647 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01647 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01647 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01647 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01647 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01647 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01647 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01647 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01647 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01647 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01647 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01647 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01647 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01647 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01647 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01647 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01647 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01647 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01647 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01647 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01647 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01647 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01647 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01647 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01647 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01647 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01647 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01647 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01647 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01647 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01647 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01647 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01647 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01647 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01647 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01647 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01647 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01647 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01647 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01647 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01647 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01647 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01647 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01647 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01647 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01647 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01647 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01647 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01647 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01647 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01647 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01647 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms