Protein–RNA interactions for Protein: P01646

Ig kappa chain V-V region HP 123E6, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01646 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01646 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01646 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01646 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01646 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01646 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01646 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01646 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01646 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01646 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01646 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01646 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01646 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01646 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01646 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01646 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01646 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01646 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01646 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01646 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01646 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01646 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01646 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01646 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01646 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01646 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01646 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01646 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01646 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01646 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01646 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01646 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01646 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01646 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01646 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01646 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01646 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01646 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01646 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01646 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01646 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01646 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01646 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01646 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01646 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01646 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01646 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01646 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01646 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01646 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01646 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01646 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01646 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01646 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01646 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01646 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01646 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01646 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01646 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01646 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01646 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01646 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01646 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01646 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01646 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01646 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01646 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01646 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01646 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01646 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01646 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01646 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01646 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01646 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01646 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01646 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01646 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01646 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01646 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01646 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01646 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01646 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01646 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01646 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01646 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01646 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01646 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01646 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01646 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01646 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01646 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01646 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01646 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01646 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01646 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01646 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01646 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01646 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01646 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01646 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms