Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stra6O70491 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Stra6O70491 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stra6O70491 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stra6O70491 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stra6O70491 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stra6O70491 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Stra6O70491 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Stra6O70491 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Stra6O70491 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Stra6O70491 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Stra6O70491 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stra6O70491 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Stra6O70491 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stra6O70491 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stra6O70491 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stra6O70491 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stra6O70491 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stra6O70491 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stra6O70491 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stra6O70491 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stra6O70491 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stra6O70491 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stra6O70491 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stra6O70491 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stra6O70491 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stra6O70491 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stra6O70491 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stra6O70491 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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Stra6O70491 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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Stra6O70491 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Stra6O70491 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Stra6O70491 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stra6O70491 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Stra6O70491 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Stra6O70491 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Stra6O70491 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Stra6O70491 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stra6O70491 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms