Protein–RNA interactions for Protein: O55055

Trdmt1, tRNA (cytosine(38)-C(5))-methyltransferase, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdmt1O55055 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdmt1O55055 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdmt1O55055 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdmt1O55055 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdmt1O55055 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdmt1O55055 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdmt1O55055 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdmt1O55055 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdmt1O55055 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdmt1O55055 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdmt1O55055 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdmt1O55055 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdmt1O55055 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdmt1O55055 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdmt1O55055 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdmt1O55055 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdmt1O55055 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdmt1O55055 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdmt1O55055 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdmt1O55055 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdmt1O55055 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdmt1O55055 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdmt1O55055 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdmt1O55055 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdmt1O55055 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdmt1O55055 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdmt1O55055 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdmt1O55055 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdmt1O55055 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trdmt1O55055 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdmt1O55055 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdmt1O55055 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdmt1O55055 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdmt1O55055 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdmt1O55055 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdmt1O55055 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdmt1O55055 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdmt1O55055 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdmt1O55055 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdmt1O55055 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdmt1O55055 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdmt1O55055 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdmt1O55055 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdmt1O55055 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Trdmt1O55055 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdmt1O55055 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdmt1O55055 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdmt1O55055 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdmt1O55055 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdmt1O55055 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdmt1O55055 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdmt1O55055 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdmt1O55055 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdmt1O55055 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Trdmt1O55055 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Trdmt1O55055 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdmt1O55055 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Trdmt1O55055 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdmt1O55055 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Trdmt1O55055 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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Trdmt1O55055 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdmt1O55055 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdmt1O55055 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdmt1O55055 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdmt1O55055 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdmt1O55055 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdmt1O55055 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdmt1O55055 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdmt1O55055 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdmt1O55055 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdmt1O55055 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdmt1O55055 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdmt1O55055 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdmt1O55055 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdmt1O55055 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdmt1O55055 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdmt1O55055 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdmt1O55055 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdmt1O55055 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdmt1O55055 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdmt1O55055 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdmt1O55055 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdmt1O55055 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdmt1O55055 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdmt1O55055 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdmt1O55055 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdmt1O55055 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdmt1O55055 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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