Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
BckdkO55028 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BckdkO55028 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BckdkO55028 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BckdkO55028 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BckdkO55028 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BckdkO55028 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
BckdkO55028 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
BckdkO55028 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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