Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffaO54786 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffaO54786 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffaO54786 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffaO54786 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffaO54786 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffaO54786 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
DffaO54786 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffaO54786 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffaO54786 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DffaO54786 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DffaO54786 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DffaO54786 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DffaO54786 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DffaO54786 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DffaO54786 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DffaO54786 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DffaO54786 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DffaO54786 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DffaO54786 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DffaO54786 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DffaO54786 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DffaO54786 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
DffaO54786 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DffaO54786 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DffaO54786 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
DffaO54786 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DffaO54786 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DffaO54786 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DffaO54786 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
DffaO54786 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
DffaO54786 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DffaO54786 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DffaO54786 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DffaO54786 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DffaO54786 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
DffaO54786 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DffaO54786 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DffaO54786 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DffaO54786 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DffaO54786 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DffaO54786 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DffaO54786 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DffaO54786 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DffaO54786 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
DffaO54786 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DffaO54786 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DffaO54786 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DffaO54786 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DffaO54786 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DffaO54786 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
DffaO54786 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DffaO54786 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DffaO54786 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DffaO54786 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DffaO54786 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DffaO54786 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DffaO54786 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DffaO54786 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DffaO54786 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
DffaO54786 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
DffaO54786 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DffaO54786 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DffaO54786 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DffaO54786 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DffaO54786 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DffaO54786 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
DffaO54786 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DffaO54786 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
DffaO54786 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DffaO54786 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
DffaO54786 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DffaO54786 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DffaO54786 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DffaO54786 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DffaO54786 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DffaO54786 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DffaO54786 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DffaO54786 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DffaO54786 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DffaO54786 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DffaO54786 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DffaO54786 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DffaO54786 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DffaO54786 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DffaO54786 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DffaO54786 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DffaO54786 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DffaO54786 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffaO54786 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffaO54786 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffaO54786 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffaO54786 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffaO54786 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffaO54786 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffaO54786 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffaO54786 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffaO54786 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffaO54786 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffaO54786 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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