Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Sp100O35892 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sp100O35892 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sp100O35892 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sp100O35892 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sp100O35892 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sp100O35892 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sp100O35892 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sp100O35892 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms