Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clk2O35491 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Clk2O35491 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clk2O35491 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clk2O35491 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clk2O35491 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk2O35491 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk2O35491 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Clk2O35491 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Clk2O35491 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk2O35491 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk2O35491 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk2O35491 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk2O35491 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk2O35491 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
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