Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Edil3O35474 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Edil3O35474 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Edil3O35474 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Edil3O35474 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Edil3O35474 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Edil3O35474 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Edil3O35474 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Edil3O35474 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Edil3O35474 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Edil3O35474 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms