Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Atf6bO35451 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Atf6bO35451 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Atf6bO35451 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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