Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms