Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms