Protein–RNA interactions for Protein: K9J7F4

Gm8720, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8720K9J7F4 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8720K9J7F4 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms