Protein–RNA interactions for Protein: J3QK38

Gm21244, MCG116195, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21244J3QK38 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21244J3QK38 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms