Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
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