Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms