Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Fndc1E9Q043 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms