Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms