Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms