Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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PtprbB2RU80 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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PtprbB2RU80 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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PtprbB2RU80 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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PtprbB2RU80 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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PtprbB2RU80 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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PtprbB2RU80 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
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PtprbB2RU80 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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PtprbB2RU80 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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PtprbB2RU80 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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