Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Ssxb8B1AY40 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Ssxb8B1AY40 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Ssxb8B1AY40 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Ssxb8B1AY40 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Ssxb8B1AY40 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssxb8B1AY40 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Ssxb8B1AY40 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Ssxb8B1AY40 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
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Ssxb8B1AY40 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Ssxb8B1AY40 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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