Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lcn6A2AJB9 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms