Protein–RNA interactions for Protein: A2A9K7

Cnksr1, Connector enhancer of kinase suppressor of Ras 1, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnksr1A2A9K7 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnksr1A2A9K7 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnksr1A2A9K7 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnksr1A2A9K7 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnksr1A2A9K7 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnksr1A2A9K7 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnksr1A2A9K7 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnksr1A2A9K7 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnksr1A2A9K7 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnksr1A2A9K7 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnksr1A2A9K7 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnksr1A2A9K7 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnksr1A2A9K7 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnksr1A2A9K7 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnksr1A2A9K7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnksr1A2A9K7 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnksr1A2A9K7 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnksr1A2A9K7 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnksr1A2A9K7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnksr1A2A9K7 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnksr1A2A9K7 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnksr1A2A9K7 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnksr1A2A9K7 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnksr1A2A9K7 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Cnksr1A2A9K7 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Cnksr1A2A9K7 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Cnksr1A2A9K7 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnksr1A2A9K7 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnksr1A2A9K7 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnksr1A2A9K7 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Cnksr1A2A9K7 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnksr1A2A9K7 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Cnksr1A2A9K7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Cnksr1A2A9K7 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnksr1A2A9K7 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnksr1A2A9K7 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnksr1A2A9K7 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnksr1A2A9K7 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnksr1A2A9K7 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnksr1A2A9K7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnksr1A2A9K7 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnksr1A2A9K7 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnksr1A2A9K7 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnksr1A2A9K7 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnksr1A2A9K7 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnksr1A2A9K7 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnksr1A2A9K7 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnksr1A2A9K7 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnksr1A2A9K7 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnksr1A2A9K7 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnksr1A2A9K7 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnksr1A2A9K7 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnksr1A2A9K7 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnksr1A2A9K7 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnksr1A2A9K7 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnksr1A2A9K7 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnksr1A2A9K7 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnksr1A2A9K7 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnksr1A2A9K7 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms