Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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