Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm4T1NXB5 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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