Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms