Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CcniQ9Z2V9 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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