Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms