Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Cldn6Q9Z262 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Cldn6Q9Z262 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Cldn6Q9Z262 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Cldn6Q9Z262 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Cldn6Q9Z262 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Cldn6Q9Z262 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Cldn6Q9Z262 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Cldn6Q9Z262 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn6Q9Z262 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn6Q9Z262 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn6Q9Z262 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn6Q9Z262 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn6Q9Z262 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn6Q9Z262 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn6Q9Z262 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn6Q9Z262 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn6Q9Z262 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn6Q9Z262 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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