Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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