Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Lgr5Q9Z1P4 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Lgr5Q9Z1P4 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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