Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms