Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

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Length 917 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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Ercc4Q9QZD4 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Ercc4Q9QZD4 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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