Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnt3Q9QZ47 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms