Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChmQ9QXG2 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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