Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

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Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
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Sfmbt1Q9JMD1 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Sfmbt1Q9JMD1 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Sfmbt1Q9JMD1 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Sfmbt1Q9JMD1 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Sfmbt1Q9JMD1 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Sfmbt1Q9JMD1 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Sfmbt1Q9JMD1 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Sfmbt1Q9JMD1 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Sfmbt1Q9JMD1 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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