Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Rabgef1Q9JM13 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Rabgef1Q9JM13 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Rabgef1Q9JM13 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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