Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms