Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgm1Q9JLF6 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms