Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
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Gde1Q9JL56 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
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Gde1Q9JL56 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Gde1Q9JL56 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Gde1Q9JL56 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Gde1Q9JL56 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Gde1Q9JL56 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Gde1Q9JL56 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Gde1Q9JL56 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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