Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms