Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Trim39Q9ESN2 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Trim39Q9ESN2 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Trim39Q9ESN2 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Trim39Q9ESN2 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Trim39Q9ESN2 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Trim39Q9ESN2 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Trim39Q9ESN2 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Trim39Q9ESN2 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms