Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB8

Vmn1r54, Vomeronasal type-1 receptor 54, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r54Q9EPB8 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r54Q9EPB8 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms