Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms