Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Swt1Q9DBQ9 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Swt1Q9DBQ9 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Swt1Q9DBQ9 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Swt1Q9DBQ9 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Swt1Q9DBQ9 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Swt1Q9DBQ9 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Swt1Q9DBQ9 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Swt1Q9DBQ9 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Swt1Q9DBQ9 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Swt1Q9DBQ9 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Swt1Q9DBQ9 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Swt1Q9DBQ9 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Swt1Q9DBQ9 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Swt1Q9DBQ9 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Swt1Q9DBQ9 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Swt1Q9DBQ9 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Swt1Q9DBQ9 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Swt1Q9DBQ9 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Swt1Q9DBQ9 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Swt1Q9DBQ9 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Swt1Q9DBQ9 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms