Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Smg9Q9DB90 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms