Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms