Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4B1

Sgms2, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sgms2Q9D4B1 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Sgms2Q9D4B1 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Sgms2Q9D4B1 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Sgms2Q9D4B1 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Sgms2Q9D4B1 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Sgms2Q9D4B1 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Sgms2Q9D4B1 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Sgms2Q9D4B1 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Sgms2Q9D4B1 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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