Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syce1Q9D495 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms