Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

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Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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